ניקוי משאבת פילטר נדרש לעיתים קרובות יחסית - פירוק ושטיפה כל כמה ימים והחלפת המצע אחת לשבועיים.

משאבת פילטר לבריכות שחייה מיועדת לסנן את מי הבריכה מחול ולכלוך קטן. היא זולה יותר ממשאבת חול ובהחלט מספיקה למי שמשתמש בבריכה רק בחודשי הקיץ. אך שימו לב - משאבה שלא מתוחזקת כראוי יכולה להיסתם, להפסיק לסנן את המים בבריכה ובהמשך גם להיהרס לגמרי  סתם חבל.