כל עקירה נחשבת תהליך כירורגי, אבל כשמדברים על עקירה כירורגית מתייחסים לרוב לעקירה שדורשת פעולות פולשניות בפה כדי להוציא את השן.
עקירה כירורגית מבוצעת לרוב בהרדמה מקומית (למרות שהמילה כירורגית שם, לא מדובר על ניתוח מלא) ותידרשו לבצע אותה במקרים הבאים:
שן כלואה - שן כלואה היא שן שנמצאת מתחת לחניכיים ולא רואים אותה, כדי לעקור אותה תידרשו לעקירה כירורגית.
כתר השן פגוע - הכתר הוא החלק החיצוני של השיניים, אם הוא פגוע אין במה למשוך כדי להסיר את השן ונדרשת עקירה כירורגית.
שורשי השן - אם יש בעיה בשורשים של השן, כמו דלקת או אפילו מבנה לא אופייני שמקשה על תלישת השן, תידרשו לעקור אותה כירורגית.
בכל אופן הרופא המטפל יחליט איזו עקירה הכי מתאימה לכם - העיקר שהכאבים יעברו! שיהיה בקלות.